Man kann die Vorlagen nicht löschen, allerdings kann man die Vorlagen einfach via Hook ausblenden.

Mit diesem Hook werden nur benutzerdefinierte Vorlagen angezeigt und so kann man dem Redakteur das finden einer Vorlage einfacher gestalten.

function atkp__modify_template_list(  $templates, $add_systemdir, $is_searchform ) {
 
     $newtemplates = array();
     
     foreach($templates as $template => $val) {
          if(is_numeric($template))
                $newtemplates[$template] = $val;
     }
     
    return $newtemplates;
}
add_filter( 'atkp_template_list', 'atkp__modify_template_list', 10, 3);